Jednou z úloh KZSL je zabezpečenie výkonu špeciálnych zisťovaní, monitoringov a ďalších činností spojených s KZSL, rámcovým plánovaním a tvorbou rámcových návrhov osobitných režimov hospodárenia.
Patrí sem najmä:
- odber pôdnych a asimilačných vzoriek v oblastiach postihnutých imisným spádom z dôvodu vymedzenia Pásiem ohrozenia imisiami,
- spolupráca na národnej inventarizácii a monitoringu lesov SR v oblasti terénneho zberu údajov,
- zisťovanie zdravotného stavu a poškodenia lesných porastov a vylyšovanie zón ohrozenia lesa terestrickými metódami a metódami s použitím DPZ.